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En nuestro laboratorio se ha identificado y caracterizado al regulador transcripcional global de la síntesis de lípidos en Bacillus subtilis (Bs), FapR, el cual controla la expresión de varios de los genes involucrados en esta vía (regulón fap). Este represor se encuentra altamente conservado en muchas bacterias Gram positivas, incluyendo varios patógenos humanos. En estos organismos la secuencia consenso de unión de FapR a las regiones promotoras putativas del regulón es invariable, sugiriendo que el mecanismo de regulación observado en Bs es conservado en estos otros organismos. FapR presenta dos dominios, uno amino-terminal hélice-giro-hélice de unión a ADN y otro, carboxilo-terminal, de unión al efector malonil-CoA. La acumulación de este metabolito libera a FapR de las regiones operadoras del regulón provocando el aumento de su expresión. Los genes regulados por FapR se encuentran agrupados en seis operones, todos ellos poseen dentro de la región promotora una secuencia consenso de 17pb palindrómica a la cual se une FapR para reprimir su transcripción. Con el objetivo de comprender el mecanismo por el cual FapR reprime diferencialmente la expresión de estos genes, decidimos estudiar en detalle la interacción entre este represor y las regiones operadoras del regulón fap. Para ello realizamos ensayos de retardo en gel y ensayos de protección frente al radical hidroxilo. Nuestros resultados indican que FapR se encuentra interaccionando con el ADN como tetrámero o dos dímeros, los cuales contactan con el ADN sobre la misma cara de la hélice. Se observó además una única región operadora para los operones estudiados indicando que la represión diferencial de cada uno de ellos se debe, probablemente, a una diferencia en la afinidad de FapR por los mismos y no al número de regiones operadoras.