EVIDENCIA DE RECOMBINACIÓN HOMOLOGA EN VIRUS CHIKUNGUNYA

PABLO CASAL; DIEGO CHOUHY; ELISA BOLATTI; GERMÁN R. PÉREZ; EMMA J. STELLA; ADRIANA A. GIRI

Buenos Aires

Congreso; XI Congreso Argentino de Virología II Congreso Latinoamericano de Virología; 2015

Sociedad Argentina de Virología

El Virus Chikungunya (CHIKV; Togaviridae: Alphavirus), es un arbovirus transmitido por mosquitos que causa fiebre aguda y dolor de las articulaciones en los seres humanos. Recientemente, diversos brotes endémicos de CHIKV han puesto en peligro la salud pública en numerosas regiones geográficas del mundo, causando millones de casos en más de 50 países. Si bien en Argentina hasta el momento no se han registrado casos de fiebre Chikungunya autóctonos, existe un brote epidémico que abarca numerosos países del Caribe, América Central y Sudamérica.En este trabajo, se analizaron las asociaciones filogenéticas de las cepas de CHIKV depositados en la base de datos GenBank y se exploraron los posibles eventos de recombinación en 152 aislamientos genómicos. Mediante análisis Bayesiano se definieron los tres genotipos de CHIKV [West African, Asian, East/Central/South African (ECSA)], y se obtuvo una clara división del genotipo ECSA en tres subgrupos (I-II-III). Resultados similares se obtuvieron utilizando secuencias de genomas completos y del gen E1. Para facilitar la clasificación de CHIKV dentro del clado ECSA aquí proponemos un valor de corte basado en la identidad nucleotídica que se puede aplicar, ya sea en el análisis de genomas completos, así como en el del gen E1. Sucesivamente se exploraron posibles eventos de recombinación utilizando siete métodos bioinformáticos (RDP, GENECONV, BootScan, MaxChi, CHIMAERA, SIScan, 3Seq). Este análisis permitió identificar un evento estadísticamente significativo (rango de p: 1.14x10-7 - 4.45x10-24) situado dentro de la región codificante de la proteína no estructural 3 (nsP3). Este hallazgo se confirmó mediante la construcción de redes filogenéticas usando el programa SplitTree (Test PHI, p = 0,004) y por el análisis de incongruencias filogenéticas. La cepa recombinante, KJ679578/India/2011 (ECSA III), fue aislada del suero de un paciente visitando Calcuta (India) y deriva de cepas pertenecientes a los subgrupos ECSA III y ECSA I. El virus recombinante carece de las sustituciones adaptativas (primera, E1-A226V; segundas, E2-E2-K252Q y L210Q) de CHIKV en Aedes albopictus, lo que sugiere que la cepa KJ679578/India/2011 se ha transmitido principalmente por Aedes aegypti. En conclusión, este estudio demuestra por primera vez a la recombinación como un mecanismo adicional de diversidad genética en CHIKV, y podría facilitar el proceso de transmisión inter-especies.