Validación de la sobreexpresión tumoral de 18 genes en cáncer colorrectal

JM ARRIAGA; EM LEVY; C ZUCCHINI; P DE SANCTIS; L VALVASSORI; S MORALES BAYO; A I BRAVO; MM BARRIO; G SYCZ; M ARIS; E HUERTAS; J MORDOH; M BIANCHINI

Mar del Plata, Provincia de Buenos Aires, Argentina

Congreso; Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigaciones Clínicas (SAIC); 2008

SAIC

El cáncer colorrectal, el tumor de mayor incidencia en Buenos Aires y el segundo a nivel mundial, está caracterizado por una marcada diferencia en la expresión génica con respecto a la mucosa intestinal normal. Dicha diferencia necesita ser mejor caracterizada, tanto para comprender mejor los mecanismos que llevan a la tumorigénesis, como para encontrar marcadores moleculares tumorales de utilidad en la práctica clínica. Para ello se realizó previamente en nuestro laboratorio un estudio de cDNA microarrays en el cual se encontraron 1.306 genes sobre o subexpresados >1,5 veces en el tumor, con respecto a la  mucosa normal (p<0,001). El objetivo del presente trabajo es validar la sobreexpresión tumoral de 18 de estos genes, mediante qRT-PCR en 7 nuevos pacientes, de diferentes estadíos tumorales. Los genes seleccionados fueron el IFNγ, 6 canales de membrana, 4 genes de función desconocida, y 8 surgidos de un análisis de "display digital diferencial" (DDD), que revela aquellos genes sobreexpresados en las muestras de cáncer colorrectal utilizadas en el microarray con respecto a  bases de datos de expresión de otros tejidos normales y tumorales. Tomando como valor de corte una sobreexpresión tumoral de ≥1,5 veces, de los pacientes estudiados se encontró sobreexpresión en: 6/7 para PAK6, GRHL1 y SLC2A1; 5/7 para IFNγ, LNP, y GDA; 4/7 para SLCO1A2, SLC22A11, SELI y SQSTM1; 3/7 para RABL3, F2 y TRIM74; 2/7 para SLC30A5 y TMEM56; 1/7 para SLC7A2 y SLC16A1; y 0/7 para TMEM130. A pesar del pequeño número de casos, 4 de los genes mostraron diferencia significativa (p<0,05). Para algunos de estos genes se validó su sobreexpresión a nivel epitelial por MDL y de proteína por WB e IHQ. Estos resultados confirman la sobreexpresión tumoral de varios de los genes estudiados por cDNA microarray, y son de utilidad para seleccionar aquellos genes que ameritan un estudio en mayor profundidad en cuanto a su posible rol en la oncogénesis colorrectal y como posibles marcadores tumorales.